含的尼古丁及一氧化碳拖缓了骨胳的再生的进度。尼古丁令血管收缩，降低了流到新生骨骼的血量。吸烟时吸入的一氧化碳，亦同时减少进入身体的氧气比率。吸烟会引致盘骨炎及背痛。每天抽烟十支以上，将盘骨炎患病率提高一倍。有严重背痛的人大部份都有很大烟瘾，这是由于吸烟会引致流向关节盘的血液减少，关节盘因而提早退化。吸烟会引致关节炎。每天吸食一包烟，将提高患病率达50%。停经后女性吸烟者更容易患骨折及关节病。吸烟导致骨质流失更快。妇女由青春期至踏入更年期，每日持续吸烟一包，其骨骼比非吸烟者少百分之五至十。当步入更年期后吸烟者的骨质流失率更快。吸烟会干扰雌激素，而雌激素正是骨骼发展的重要荷尔蒙。吸烟是导致慢性阻塞气管疾病的主要发病因素。
肝脏——吸烟会加重肝脏负担。经常抽烟会影响肝脏的脂质代谢作用，令血中脂肪增加，使到良性胆固醇减少，恶性胆固醇增加。这个原因令肝脏的解毒功能增加负担。
肺部——吸烟会引致肺癌。90%的总死亡率是由吸烟所导致。一个人每天吸食十支烟，其患病率是非吸烟人士之十倍。 吸烟的女人
被破坏的细胞不能回复正常。初期病症不会被察觉，直至癌性细胞漫延至血管及其他器官。(到目前为止，肺癌是造成人类死亡最多的一种癌症，同时肺癌几乎无法早期发现。被诊断为肺癌的患者3年后的存活率低于5%，5年后的存活率几乎为零。医生们建 议：吸烟人应每隔3～6个月做一次胸部透视，如出现干咳、痰中有血丝、胸内隐痛及发热等症状时，切不可掉以轻心，应立即去医院进行痰脱落细胞检查。只有这样才能增加早期发现肺癌的可能性。)吸烟亦会引致肺气肿，肺部支气管内积聚之有毒物质，会阻碍人体吸入之空气正常呼出，令肺部细胞膨胀或爆裂，导致患病者呼吸困难。重度肺气肿患者是十分痛苦的，为了吸入足够的氧气，他们不得不上体直立且高频率地喘息，即使在平地上他们也必须慢慢地行走。有些更严重的患者则必须依靠氧气袋才能维持生命，他们在有生之年必须集中全部的努力去做一个简单的动作——喘气。
吸烟是导致慢性阻塞气管疾病的主要发病因素。因为吸烟能引致支气管上皮细胞的纤毛变短和不规则及其和运动发生障碍，降低局部性抵抗力，容易受到感染。
有的医生认为，与肺气肿相比，肺癌应算作是一种十分仁慈的疾病，因为肺癌使人痛苦的时间与肺气肿相比要短得多。
胃部——患有肠胃性疾病者，吸烟足以使肠胃病更恶化。患有胃溃疡或十二指肠溃疡者，溃疡处的愈合会减慢，甚至演变为慢性病。吸烟能刺激神经系统，加速唾液及胃液的分泌，使胃肠时常出现紧张状态，导致吸烟者食欲不振。另外，尼古丁会使胃肠黏膜的血管收缩，亦令食欲减退。
